Prof. Dr. rer. nat. habil. Tom Goldammer

+49 38208 68-702
Forschungsinstitut für Nutztierbiologie (FBN)
Institut für Genombiologie
Abteilung Fischgenetik
Wilhelm-Stahl-Allee 2
18196 Dummerstorf

Forschungsinteressen

Genombiologische Grundlagen des Anpassungsvermögens, der Robustheit und von Mechanismen des angeborenen Immunsystems von Fischen unter dem Einfluss differenter Stressfaktoren in der Aquakultur

Lebenslauf

  • seit 2019: Universitätsprofessor für Molekularbiologie und Genetik der Fische an der Agrar- und Umweltwissenschaftlichen Fakultät der Universität Rostock
  • 2016–2018: Institutsleitung Institut für Genombiologie
  • seit 2008: Leiter der Abteilung Fischgenetik, FBN Dummerstorf
  • 2005–2019: Privatdozent (Genetik), Universität Rostock
  • 2005: Habilitation und Venia legendi (Genetik), Universität Rostock
  • 2001–2008: Wissenschaftlicher Mitarbeiter, FBN Dummerstorf
  • 1999–2001: Postdoctoral Research Fellow, Texas A&M University, Dept. Veterinary Pathobiology, Texas, USA, (Prof. Dr. J. Womack)
  • 1996: Promotion Dr. rer. nat. (Genetik), Universität Rostock, bei Prof. Dr. M. Schwerin
  • 1992–1999: Wissenschaftlicher Mitarbeiter, FBN Dummerstorf
  • 1991–1992: Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Universität Rostock
  • 1991: Diplom (Biologie), Universität Rostock
  • 1986–1991: Studium der Meeresbiologie an der Universität Rostock

berufliche Aktivitäten

  • seit 2009: Koordinator des Campus BioFISCH MV (EFF & ESF Projekte)
  • seit 2009: Editorial Advisory Board Member bei Chromosome Research
  • seit 2006: International Society for Animal Genetics (ISAG)
  • 2000–2001: Texas Genetics Society (TGS)

Publikationen

Schäfer, N.; Kaya, Y.; Rebl, H.; Stüecken, M.; Rebl, A.; Nguinkal, J.A.; Franz, G. P.; Brunner, R. M.; Goldammer, T.; Grunow, B.; Verleih, M. (2021):
Insights into early ontogenesis: characterization of stressand development key genes of pikeperch (Sander lucioperca) in vivo and in vitro. Fish Physiol Biochem 47 (2): 515-532
Schäfer, N.; Matoušek, J.; Rebl, A.; Stejskal, V.; Brunner, R. M.; Goldammer, T.; Verleih, M.; Korytar, T. (2021):
Effects of Chronic Hypoxia on the Immune Status of Pikeperch (Sander lucioperca Linnaeus, 1758). Biology 10 (7): 649, 1-19
Galow, A.-M.; Kussauer, S.K; Wolfien, M.; Brunner, R. M.; Goldammer, T.; Hoeflich, A.; David, R. (2021):
Quality control in scRNA-Seq can discriminate pacemaker cells: the mtRNA bias. Cell Mol Life Sci 78: 1-8
Nguinkal, J.A.; Verleih, M.; de los Rios Pérez, L.; Brunner, R. M.; Sahm, A.; Bej, S.; Rebl, A.; Goldammer, T. (2021):
Comprehensive characterization of multitissue expression landscape, co-expression networks and positive selection in pikeperch. Cells-Basel
Goldammer, T.; Verleih, M.; Brunner, R. M.; Rebl, A.; Nguinkal, J.A.; de los Rios Pérez, L.; Schäfer, N.; Stüecken, M.; Swirplies, F.; Wittenburg, D. (2021):
Pikeperch genome data – basis for the smart farming in aquaculture. Mitteilungen der Landesforschungsanstalt für Landw (63): 125-133
Martorell Ribera, J.; Nipkow, M.; Viergutz, T.; Brunner, R. M.; Bochert, R.; Koll, R.; Goldammer, T.; Gimsa, U.; Rebl, A. (2020):
Early response of salmonid head-kidney cells to stress hormones and toll-like receptor ligands. Fish Shellfish Immun 98: 950-961
Koll, R.; Martorell Ribera, J.; Brunner, R. M.; Rebl, A.; Goldammer, T. (2020):
Gene profiling in the adipose fin of salmonid fishes supports its function as a flow sensor. Genes-Basel 11 (1): 21, 1-22
Wolfien, MW; Galow, A.-M.; Müller, P.; Bartsch, M.; Brunner, R. M.; Goldammer, T.; Wolkenhauer, O.; Höflich, A.; David, R. (2020):
Single-nucleus sequencing of an entire mammalian heart: cell type composition and velocity. Cells-Basel 9 (2): 318,1-6
Wolfien, M.; Galow, A.-M.; Müller, P.; Bartsch, M.; Brunner, R. M.; Goldammer, T.; Wolkenhauer, O.; Höflich, A.; David, R. (2020):
Single nuclei sequencing of entire mammalian hearts: strain-dependent cell type composition and velocity. Cardiovasc Res 116 (7): 1249-1251
Galow, A.-M.; Wolfien, M.; Müller, P.; Bartsch, M.; Brunner, R. M.; Hoeflich, A.; Wolkenhauer, O.; David, R.; Goldammer, T. (2020):
Integrative cluster analysis of whole hearts reveals proliferative cardiomyocytes in adult mice. Cells-Basel 9 (5): 1144,1-16
Sarais, F.; Rebl, H.; Verleih, M.; Ostermann, S.; Krasnov, A.; Köllner, B.; Goldammer, T.; Rebl, A. (2020):
Characterisation of the teleostean κB-Ras family: The two members NKIRAS1 and NKIRAS2 from rainbow trout influence the activity of NF-κB in opposite ways. Fish Shellfish Immun 106: 1004-1013
Rebl, A.; Korytár, T.; Borchel, A.; Bochert, R.; Strzelczyk, J.; Goldammer, T.; Verleih, M. (2020):
The synergistic interaction of thermal stress coupled with overstocking strongly modulates the transcriptomic activity and immune capacity of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Sci Rep-UK 10: 14913, 1-15
de los Rios Pérez, L.; Brunner, R. M.; Hadlich, F.; Rebl, A.; Kühn, C.; Wittenburg, D.; Goldammer, T.; Verleih, M. (2020):
Comparative analysis of the transcriptome and distribution of putative SNPs in two rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) breeding strains by using next-generation sequencing. Genes-Basel 11: 841, 1-16
Martorell Ribera, J.; Venuto, M.; Otten, W.; Brunner, R. M.; Goldammer, T.; Rebl, A.; Gimsa, U. (2020):
Time-dependent effects of acute handling on the brain monoamine system of the Salmonid Coregonus maraena. Front Neurosci 14: 1293, 1-18
Galow, A.-M.; Goldammer, T.; Hoeflich, A. (2020):
Xenogeneic and stem cell-based therapy for cardiovascular diseases: genetic engineering of porcine cells and their applications in heart regeneration. Int J Mol Sci 21 (24): 9686, 1-22
de los Rios Pérez, L.; Nguinkal, J.A.; Verleih, M.; Rebl, A.; Brunner, R. M.; Klosa, J.; Schäfer, N.; Stüeken, M.; Goldammer, T.; Wittenburg, D. (2020):
An ultra-high density SNP-based linkage map for enhancing the pikeperch (Sander lucioperca) genome assembly to chromosome-scale. Sci Rep-UK 10 (22335): 1-13
Swirplies, F.; Würtz, S.; Baßmann, B.; Orban, A.; Schäfer, N.; Brunner, R. M.; Hadlich, F.; Goldammer, T.; Rebl, A. (2019):
Identification of molecular stress indicators in pikeperch Sander lucioperca correlating with rising water temperatures. Aquaculture 501: 260-271
Rebl, A.; Rebl, H.; Verleih, M.; Haupt, S.; Goldammer, T.; Seyfert, H.-M. (2019):
At least two genes encode many variants of Irak3 in rainbow trout, but neither the full-length factor nor its variants interfere directly with the TLR-mediated stimulation of inflammation. Front Immunol 10: 2246, 1-19
Montero, R.; Strzelczyk, J.; Tze Ho Chan, J.; Verleih, M.; Rebl, A.; Goldammer, T.; Köllner, B.; Korytár, T. (2019):
Dawn to dusk: Diurnal rhythm of the immune response in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Biology 9 (1): 8, 1-13
Verleih, M.; Borchel, A.; Rebl, A.; Brenmoehl, J.; Kühn, C.; Goldammer, T. (2019):
A molecular survey of programmed cell death in rainbow trout: Structural and functional specifications of apoptotic key molecules. Comp Biochem Phys B 230: 57-69