PD Dr. rer. nat. habil. Dörte Wittenburg
Forschungsinteressen
- Computational Statistics
- Statistische Methoden zur Identifizierung von merkmalsassoziierten Varianten im Genom
- Schätzung von populationsgenetischen Parametern
Lebenslauf
- 2021: Habilitation und Venia Legendi in Tierzucht und Haustiergenetik
Thema: Statistical perspectives on dependencies between genomic markers - Seit 2019: Leitung der Arbeitsgruppe „Statistische Methoden in der Genomik“, FBN Dummerstorf
- 2013-2018: Leitung der Nachwuchsforschergruppe „Genomgestützte Phänotypvorhersage“, FBN Dummerstorf
- 2008-2012: Postdoc der Nachwuchsforschergruppe „BovIBI: Integrative Bioinformatik in der Genomischen Selektion beim Rind“, FBN Dummerstorf
- 2005-2008: Doktorarbeit in statistischer Genetik (Dr. rer. nat. in Biomathematik), FBN Dummerstorf und Universität Greifswald
Thema: Statistische Modellierung der Variabilität des Geburtsgewichts innerhalb Wurf beim Schwein - 2000-2005: Studium der Wirtschaftsmathematik (Dipl.-Math. oec.), Universität Rostock
Diplomarbeitsthema: Lineare und verallgemeinerte lineare Modelle zum Nachweis von QTL-Effekten auf die Varianz wiederholter Messungen
Lehre
Vorlesungen im Modul „Statistische Modellierung und Versuchsplanung“ im Masterstudiengang Nachhaltige Agrarsysteme an der Universität Rostock, AUF
Angebotene Masterarbeiten im Fachgebiet Tierzucht und Haustiergenetik unter https://www.auf.uni-rostock.de/studium/studienorganisation/angebot-abschlussarbeiten/
Publikationen
Wittenburg, D.; Melzer, N.; Abdollahi Sisi, N.; Ding , X.; Seefried, F. R. (2026):
A comparative study on recombination activity in cattle
Genetics Selection Evolution 58: 24, 1-16
https://doi.org/10.1186/s12711-026-01041-0
Klosa, J.; Simon, N.; Liebscher, V.; Wittenburg, D. (2023):
A fitted sparse-group lasso for genome-based evaluations
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 20 (1): 30-38
https://doi.org/10.1109/TCBB.2022.3156805
Melzer, N.; Qanbari, S.; Ding, X.; Wittenburg, D. (2023):
CLARITY: a Shiny app for interactive visualisation of the bovine physical-genetic map
Frontiers in Genetics 14: 1082782, 1-10
https://doi.org/10.3389/fgene.2023.1082782
Piepho, H.P.; Gabriel, D.; Hartung, J.; Büchse, A.; Grosse, M.; Kurz, S.; Laidig, F.; Michel, V.; Proctor, I.; Sedlmeier, J.E.; Toppel, K.; Wittenburg, D. (2022):
One, two, three: portable sample size in agricultural research
The Journal of Agricultural Science 160 (6): 459-482
https://doi.org/10.1017/S0021859622000466
Qanbari, S.; Schnabel, R. D.; Wittenburg, D. (2022):
Evidence of rare misassemblies in the bovine reference genome revealed by population genetic metrics
Animal Genetics 53 (4): 498-505
https://doi.org/10.1111/age.13205
de los Rios Pérez, L.; Druet, T.; Goldammer, T.; Wittenburg, D. (2022):
Analysis of Autozygosity Using Whole-Genome Sequence Data of Full-Sib Families in Pikeperch (Sander lucioperca)
Frontiers in Genetics 12: 786934, 1-9
https://doi.org/10.3389/fgene.2021.786934
de los Rios Pérez, L.; Nguinkal, J. A.; Verleih, M.; Rebl, A.; Brunner, R. M.; Klosa, J.; Schäfer, N.; Stüeken, M.; Goldammer, T.; Wittenburg, D. (2020):
An ultra-high density SNP-based linkage map for enhancing the pikeperch (Sander lucioperca) genome assembly to chromosome-scale
Scientific Reports 10: 22335, 1-13
https://doi.org/10.1038/s41598-020-79358-z
Klosa, J.; Simon, N.; Westermark, P. O.; Liebscher, V.; Wittenburg, D. (2020):
Seagull: lasso, group lasso and sparse-group lasso regularisation for linear regression models via proximal gradient descent
BMC Bioinformatics 21: 407, 1-8
https://doi.org/10.1186/s12859-020-03725-w
de los Rios Pérez, L.; Brunner, R. M.; Hadlich, F.; Rebl, A.; Kühn, C.; Wittenburg, D.; Goldammer, T.; Verleih, M. (2020):
Comparative analysis of the transcriptome and distribution of putative SNPs in two rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) breeding strains by using next-generation sequencing
Genes 11 (8): 841, 1-16
https://doi.org/10.3390/genes11080841
Wittenburg, D.; Bonk, S. M.; Doschoris, M.; Reyer, H. (2020):
Design of experiments for fine-mapping quantitative trait loci in livestock populations
BMC Genetics 21: 66, 1-14
https://doi.org/10.1186/s12863-020-00871-1
Nguinkal, J. A.; Brunner, R. M.; Verleih, M.; Rebl, A.; de los Rios Pérez, L.; Schäfer, N.; Hadlich, F.; Stüeken, M.; Wittenburg, D.; Goldammer, T. (2019):
The first highly contiguous genome assembly of pikeperch (Sander lucioperca), an emerging aquaculture species in Europe
Genes 10 (9): 708, 1-14
https://doi.org/10.3390/genes10090708
Reyer, H.; Oster, M.; Wittenburg, D.; Murani, E.; Ponsuksili, S.; Wimmers, K. (2019):
Genetic contribution to variation in blood calcium, phosphorus, and alkaline phosphatase activity in pigs
Frontiers in Genetics 10: 590, 1-12
https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00590
Boerner, V.; Wittenburg, D. (2018):
On estimation of genome composition in genetically admixed individuals using constrained genomic regression
Frontiers in Genetics 9: 185, 1-14
https://doi.org/10.3389/fgene.2018.00185
Hampel, A.; Teuscher, F.; Gomez-Raya, L.; Doschoris, M.; Wittenburg, D. (2018):
Estimation of Recombination Rate and Maternal Linkage Disequilibrium in Half-Sibs
Frontiers in Genetics 9: 186, 1-13
https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2018.00186
Hampel, A.; Teuscher, F.; Wittenburg, D. (2016):
A likelihood approach for the estimation of recombination rate and linkage disequilibrium in half-sib families . Schriftenreihe / Leibniz-Institut für Nutztierbiol 25: 9-12