Genombiologie – Versuchsbasis


Tierarten:

  • Rind (Färsen, Kühe)
  • Schwein (verschiedene Rassen)
  • Maus (Mäuse aus Zuchtlinien des FBN)
  • Transgene und Knockout Mäuselinien (IGFBP-2, GHR)
  • Geflügel (verschiedene Hühnerrassen) und in ovo Experimente
  • Fisch (Schnäpel, Zander, Forelle)

Methodenspektrum

Zellkulturlabor

  • Primärzellkulturen (Schwein, Huhn, Rind, Zander, Maus), Zelllinien
  • Durchlicht- und Fluoreszenzmikroskopie
  • konfokale Laser-Mikroskopie
  • Live-Cell-Imaging
  • computergestützte Bildverarbeitung / Bildanalysesysteme
  • Dreidimensionale Bildzytometrie, Densitometrie
  • Mikroinjektion in somatische Zellen
  • elektrophysiologische Stimulation an Muskelzellen

Zellphysiologische Methoden

  • Histologie, Kryostatmikrotomie
  • Gewebestrukturanalytik
  • In-situ-Hybridisierung (Chromosomen, Zellen und Gewebe)
  • Immunhistochemie
  • Proliferationsassay
  • Real time Respirometrie und glykolytische Aktivitätsmessungen
  • Blutbildanalysen

Biochemische / molekularbiologische Methoden

  • DNA- und RNA-Isolierung, PCR,RT-qPCR, Klonierung
  • Elektrophorese (SDS-Page, IEF, präparative Elektrophorese)
  • EMSA (Electrophoretic Mobility Shift Assay)
  • ChIP (Chromatin Immunoprecipitation)
  • DNA Methylierungsanalyse (Pyrosequencing)
  • Sanger Sequenzierung
  • Chart-PCR (Chromatin accessibility assay by real-time PCR)
  • Reporterassays
  • Gene Editing 
  • Western blotting
  • Kapillar-Immun-Elektrophorese
  • Metabolitanalytik (klinische Chemie, RIA, ELISA, ECLIA)

Hochdurchsatz Analytik

  • Next Generation Sequencing (WGS, RNA-Seq, small RNA-Seq, RRBS, WGBS, 16S-Seq)
  • Gerichtete Hochdurchsatz-Genexpressionsanalyse
  • Hochdurchsatz Genotypisierung
  • Projektspezifische Genotypisierung (KASP, Taqman)
  • Massenspektrometrie
  • Multiplex Immunoassays